Os principais ecosistemas do Parque Nacional das Illas Atlánticas de Galicia son:
A luz e as ondas, xunto coa profundidade e as características do substrato, condicionan a distribución da FLORA MARÍTIMA:
Na cara oeste das illas, onde bate coa forza o mar, hai refuxios da corrente onde se poden atopar algas pardas dos xéneros Laminaria e Saccorhiza, que forman auténticos bosques submariños.
Tamén destacan os fondos de maërl, que están formados pola agregación de miles de algas coralináceas de pequeno tamaño e de varias especies.
A FLORA TERRESTRE debe protexerse da secura, a sal e o vento, e conforma paisaxes moi diferenciadas grazas á súa variada vexetación:
A azucena de mar, o barrón e o alhelí de mar son algunhas das especies representativas destes medios. Máis escasas, pero de grande importancia, son a camariña e a Armeria pungens.
Destaca, ademais, a Angelica pachycarpa como planta exclusiva do noroeste peninsular, asociada aos cantís frecuentados por colonias de gaivotas.
A gran variedade de ambientes no medio mariño do Parque Nacional das Illas Atlánticas de Galicia proporciona unha elevada diversidade da súa fauna, que o caracteriza e faino único:
Nas zonas rochosas, máis batidas polo mar, habitan organismos que desenvolveron mecanismos para fixarse ás rochas: percebes, arneiróns, mexillóns, ourizos de mar, etc.
Desde a franxa intermareal, e á medida que aumenta a profundidade, refúxianse entre as fendas ourizos de mar, anémonas, bigaros, cangrexos, gobios ou polbos.
Os fondos de area, ao carecer de substrato fixo, condicionan a algúns organismos a vivir soterrados, como é o caso das navallas, os berberechos ou as ameixas, mentres que outros se mimetizan sobre a superficie como o rodaballo, o choco ou o cangrexo ermitán.
Outros fondos móbiles son os formados por algas calcáreas, chamados de maërl, e os fondos de cascallo, compostos por restos de cunchas.
A abundancia de organismos mariños sostén poboacións de aves mariñas como as gaivotas patiamarelas e os corvos mariños cristados, que constitúen importantes colonias a nivel mundial e, en menor medida, gaivota escura, paíño europeo e a pardela cincenta. Tamén aproveitan estes recursos as aves invernantes ou en paso migratorio, como o corvo mariño grande, o mascato, a pardela balear, o arao romeiro e o carrán cristado.
Nas zonas de menor influencia mariña habitan aves como o falcón peregrino, anfibios como a píntega, réptiles como o escáncer de cinco dedos e a lagarta ocelada, ou insectos como a escasa bolboreta Zerynthia rumina.
Os mamíferos son escasos no Parque, aínda que son abundantes os coellos (que practicamente non teñen depredadores) e, nos últimos anos, reapareceu a nutria.